基本信息

姓 名 : 刘健

性 别 :

所属部门: 计算机科学与技术系

行政职务: 副所长

职 称 : 教授

学 历 : 博士

所学专业: 计算机应用技术

办公电话:

电子邮件: jianliu@nankai.edu.cn

研究方向: 人工智能、IT+BT、生物医药大数据、生物信息学、精准医学

个人简介:

刘健,教授,博士生导师,大数据技术研究所副所长,药物化学生物学全国重点实验室PI。曾参与“十三五”国家生物技术发展专项规划、中国生物领域技术“2030”发展战略规划、科技创新 2030 重大项目等国家重大发展战略咨询服务工作,担任第五届中国计算机学会生物信息学会议组织委员会主席等。


研究方向:

聚焦IT+BT交叉领域,主要包括人工智能、生物医药大数据、生物信息学、AI医药研发、精准医学等。


学术兼职

现任中国计算机学会生物信息学专委会委员、中国人工智能学会生物信息学与人工生命委员会委员、中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员等


工作经历:

2014年-2019年 哈尔滨工业大学 计算机学院 讲师、副教授

2019至今 南开大学 计算机学院 教授


国家级/省部级重要科研项目:

近年来完成/承担国家863计划、国家重大专项、国家重点研发计划、国家自然科学基金、天津市重点项目等科研项目10余项:

1、国家863计划重大项目,生物大数据表述索引、搜索与存储访问关键技术研发(2007万)

2、国家重大专项项目,新药信息化技术平台研究(544万)

3、国家重点研发计划项目,微生物大数据分析技术与关键算法研发(329万)

4、国家重点研发计划项目,面向合成生物系统的人工智能算法研究与应用(277万)

5、国家自然科学基金项目,海量变异数据管理关键技术研究

6、国家自然科学基金项目,人体微生物精细鉴定、注释可视化与多组学整合分析关键技术研究

7、天津市重点项目,多组学大数据智能分析方法研究


代表性论文:

1. Z. Ruan, W. Zhou, H. Liu, J. Wei, Y. Pan, C. Yan, X. Wei, W. Xiang, C. Yan, S. Chen, Jian Liu*, Precise detection of cell-type-specific domains in spatial transcriptomics, Cell Reports Methods, 2024

2. Z. Ruan, F. Lin, Z. Zhang, J. Cao, W. Xiang, X. Wei, Jian Liu*, Pairpot: A Database with Real-time Lasso-based Analysis Tailored for Paired Single-cell and Spatial Transcriptomics, Nucleic Acids Research, 2024

3. C. Yan, J. Sun, Y. Guan, J. Feng, H. Liu* and Jian Liu*, PhiHER2: Phenotype-informed weakly supervised model for HER2 status prediction from pathological images, Bioinformatics/ISMB2024, 2024

4. W. Zhou, W. X., J. Yu, Z. Ruan, Y. Pan, K. Wang* and Jian Liu*, NeoTCR: an immunoinformatic database of experimentally-supported functional neoantigen-specific TCR sequences, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2024

5. J. Lu*, P. Huang, J. Sun, Jian Liu*, DupScan: predicting and visualizing vertebrate genome duplication database, Nucleic Acids Research, 2023

6. P. Li, H. Liu, J. Sun, J. Lu*, Jian Liu*. HiBrowser: An Interactive and Dynamic Browser for Synchronous Hi-C Data Visualization, Briefings in Bioinformatics, 2023


人才培养:

近年来在Cell子刊、Nucleic Acids Research、Bioinformatics、IEEE Transactions系列期刊等发表高水平论文60余篇,培养硕士、博士研究生以及国际留学生多人。


招收计划:

每年计划招收博士后1-2人,博士生2人,硕士生3人,硕博联合培养研究生1-2人。具有充足的科研经费支持,根据科研需要鼓励和资助参与国内外学术交流以及赴海外合作课题组进修。

2025研究生推免招生名额所剩有限,欢迎对人工智能、IT+BT、生物医药大数据、生物信息学等感兴趣的计算机软件相关专业同学尽早与我联系(jianliu@nankai.edu.cn),联系地址:天津市津南区海河教育园区同砚路38号南开大学计算机学院518、522室。详情请见中心主页:http://bio.nankai.edu.cn/index.html